通常来说，公鱼除了尾鳍更宽大、更飘逸、更艳丽外，包括身体部位也具有更多的花色，而孔雀鱼的母鱼相对来说虽然尾鳍也大一些，不过却不是很鲜艳，很重要的一点是母鱼的体色暗淡，多数没有花纹。另外就是腹鳍的形状判断，很直观，公鱼腹鳍成管状，而母鱼则是扇形，这个我就不多解释了。
如果是没有发色的孔雀鱼小鱼苗，那么公母的判断就几乎没有什么对比，我们一般只能在发色之后才能准确判断。
雄鱼：雄鱼尾柄及尾鳍占身长的2/3左右，尾鳍形状有琴尾、圆尾、旗尾、冠尾、三角尾、燕尾、上剑尾、下剑尾、双剑尾、矛尾、针尾（区别于疾病“针尾”）等各种形状。
雌鱼：雌鱼体长最长可达6厘米，其尾柄及尾鳍占全身的1/3以上，各鳍均较雄鱼的短，较雄鱼体色逊色得多，多为单一银灰色，尾鳍上虽有一些花纹，均没有雄鱼的鲜艳。
孔雀鱼的公母怎么区分？ 从体型大小上区分 相对来说，母孔雀鱼的体型会比公鱼大一些，特别是肚子，即使在没有吃饱的情况下也是圆鼓鼓的，如果是即将生产的母孔雀鱼，肚子大的特征更为明显。而公孔雀鱼无论是体形和肚子都会比母孔雀鱼小很多。
从颜色艳丽程度上区分 公的颜色比较亮丽，而且看起来五彩斑斓，这有点像鸟类的孔雀，能够开屏而且漂亮的基本上都是雄性！
自然界中，很多鱼类中的雄性要比雌性更加漂亮一些，孔雀鱼也是这样。公孔雀鱼身体的色彩更丰富，颜色比母孔雀鱼更加艳丽，母孔雀的主要任务是产崽，相对公孔雀鱼来说，就没有那样艳丽的色彩了，从这点上很容易看出孔雀鱼的公母。
从胎斑来区分 母鱼拥有胎斑，是母孔雀鱼独有的特征，位于母孔雀鱼腹部靠近肛门的位置有一块有颜色的东西，野生色比较明显是黑乎乎的一块儿，就是胎斑。不同品种的母孔雀鱼胎斑颜色不同，一般呈浅红色或黑色。母鱼越是临近生产期，它的胎斑颜色就会越发明显，根据这一点也可以很容易看出孔雀鱼的雌雄。
从孔雀鱼的鱼鳍来区分 公孔雀鱼肛门处，最下方的鱼鳍呈针状，而母孔雀鱼同位置的鱼鳍呈三角形（或者叫扇形），大家可以仔细看一下这个母鱼他的臀鳍，也就是屁股下面那个鱼鳍，全部都是扇形的。公鱼的话一般都是尖尖的，那是公鱼的生殖器。一般来说养到20天就可以分出来一部分母鱼了。
